Добрый день.
Цитата: В кассу поступают ден.средства от реализации платных услуг: оплата за обучение, оплата за организацию мероприятия. При оформлении ПКО, помимо квитанции к ПКО, мы выдаем Квитанцию - БСО, отпечатанный в типографии.
Оформлять отдельный ПКО на каждую сумму не обязательно, достаточно выдавать клиенту оформленный по всем правилам БСО. В конце дня допустимо оформлять один общий ПКО на всю сумму выручки, принятой за рабочую смену, с указанием номеров использованных БСО в качестве приложения к ПКО.
Цитата: Одновременно мы вернули переплату за обучение на курсах.
Оформите РКО, попросите получателя собственноручно заполнить сумму прописью, дату и подпись.
Цитата: Вопрос: Каким штампом "получено/оплачено/погашено" закрывать ПКО и РКО и где его ставить (на ПКО/РКО, на квитанции к ПКО, на типографской квитанции или на всем сразу)?
Обязательным реквизитом БСО является печать организации (см. п. 3 ПП РФ № 359), оттиск штампа там не предусмотрен.
Что касается оформления ПКО и РКО, можно почитать обсуждение в теме
Штампы, заверяющие кассовые документы .
Несмотря на то, что вместо Положения № 373-П сейчас действуют Указания Банка № 3210-У, ничего принципиально в этом отношении не изменилось: как прописано оформление первичных документов в вашем локальном нормативном акте, так и нужно его соблюдать.